Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2f8Q58FA4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2f8Q58FA4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
E2f8Q58FA4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
E2f8Q58FA4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2f8Q58FA4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2f8Q58FA4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2f8Q58FA4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2f8Q58FA4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2f8Q58FA4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2f8Q58FA4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2f8Q58FA4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
E2f8Q58FA4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2f8Q58FA4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
E2f8Q58FA4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2f8Q58FA4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2f8Q58FA4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2f8Q58FA4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2f8Q58FA4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
E2f8Q58FA4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms