Protein–RNA interactions for Protein: Q571E5

Prss53, Serine protease 53, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss53Q571E5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prss53Q571E5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prss53Q571E5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prss53Q571E5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prss53Q571E5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prss53Q571E5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Prss53Q571E5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prss53Q571E5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prss53Q571E5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prss53Q571E5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prss53Q571E5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prss53Q571E5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prss53Q571E5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prss53Q571E5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prss53Q571E5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prss53Q571E5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prss53Q571E5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prss53Q571E5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prss53Q571E5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prss53Q571E5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms