Protein–RNA interactions for Protein: Q56A08

Gpkow, G-patch domain and KOW motifs-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpkowQ56A08 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GpkowQ56A08 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GpkowQ56A08 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GpkowQ56A08 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GpkowQ56A08 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GpkowQ56A08 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GpkowQ56A08 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GpkowQ56A08 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GpkowQ56A08 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GpkowQ56A08 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms