Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
CenpjQ569L8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CenpjQ569L8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms