Protein–RNA interactions for Protein: Q4V9W2

Srek1ip1, Protein SREK1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srek1ip1Q4V9W2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Srek1ip1Q4V9W2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms