Protein–RNA interactions for Protein: Q4U2R1

Herc2, E3 ubiquitin-protein ligase HERC2, mousemouse

Predictions only

Length 4,836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc2Q4U2R1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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