Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc3lQ4KL14 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Trappc3lQ4KL14 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms