Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Krt35Q497I4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt35Q497I4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms