Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc185Q3V118 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms