Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b4Q3V0X2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn34b4Q3V0X2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms