Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZV7

UPF0577 protein KIAA1324-like homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UZV7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3UZV7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3UZV7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3UZV7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3UZV7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3UZV7 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3UZV7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UZV7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UZV7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3UZV7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3UZV7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3UZV7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms