Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm5aQ3UXZ9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm5aQ3UXZ9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm5aQ3UXZ9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm5aQ3UXZ9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm5aQ3UXZ9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm5aQ3UXZ9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm5aQ3UXZ9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm5aQ3UXZ9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm5aQ3UXZ9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm5aQ3UXZ9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm5aQ3UXZ9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm5aQ3UXZ9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm5aQ3UXZ9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm5aQ3UXZ9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm5aQ3UXZ9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm5aQ3UXZ9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm5aQ3UXZ9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms