Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E330034G19RikQ3UWX6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms