Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms