Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms