Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl4Q3URY0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtl4Q3URY0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rtl4Q3URY0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rtl4Q3URY0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rtl4Q3URY0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rtl4Q3URY0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rtl4Q3URY0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rtl4Q3URY0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rtl4Q3URY0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rtl4Q3URY0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rtl4Q3URY0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rtl4Q3URY0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rtl4Q3URY0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rtl4Q3URY0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rtl4Q3URY0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rtl4Q3URY0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rtl4Q3URY0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rtl4Q3URY0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rtl4Q3URY0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rtl4Q3URY0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Rtl4Q3URY0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rtl4Q3URY0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rtl4Q3URY0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rtl4Q3URY0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rtl4Q3URY0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rtl4Q3URY0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rtl4Q3URY0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rtl4Q3URY0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rtl4Q3URY0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rtl4Q3URY0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rtl4Q3URY0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rtl4Q3URY0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rtl4Q3URY0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rtl4Q3URY0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rtl4Q3URY0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rtl4Q3URY0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rtl4Q3URY0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rtl4Q3URY0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rtl4Q3URY0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rtl4Q3URY0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rtl4Q3URY0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rtl4Q3URY0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rtl4Q3URY0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rtl4Q3URY0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rtl4Q3URY0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rtl4Q3URY0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rtl4Q3URY0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Rtl4Q3URY0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rtl4Q3URY0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms