Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms