Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV7

Zfp953, Zinc finger protein 953, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp953Q3UPV7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zfp953Q3UPV7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Zfp953Q3UPV7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Zfp953Q3UPV7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Zfp953Q3UPV7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Zfp953Q3UPV7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp953Q3UPV7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp953Q3UPV7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp953Q3UPV7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp953Q3UPV7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp953Q3UPV7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp953Q3UPV7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp953Q3UPV7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp953Q3UPV7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp953Q3UPV7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp953Q3UPV7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp953Q3UPV7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp953Q3UPV7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp953Q3UPV7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp953Q3UPV7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zfp953Q3UPV7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zfp953Q3UPV7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zfp953Q3UPV7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms