Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms