Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Skap2Q3UND0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Skap2Q3UND0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms