Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Tmem253Q3UNB8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Tmem253Q3UNB8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Tmem253Q3UNB8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Tmem253Q3UNB8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Tmem253Q3UNB8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Tmem253Q3UNB8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Tmem253Q3UNB8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Tmem253Q3UNB8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Tmem253Q3UNB8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Tmem253Q3UNB8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Tmem253Q3UNB8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Tmem253Q3UNB8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Tmem253Q3UNB8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Tmem253Q3UNB8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem253Q3UNB8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Tmem253Q3UNB8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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