Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cln5Q3UMW8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln5Q3UMW8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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