Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpr55Q3UJF0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gpr55Q3UJF0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gpr55Q3UJF0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gpr55Q3UJF0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpr55Q3UJF0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpr55Q3UJF0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpr55Q3UJF0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpr55Q3UJF0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpr55Q3UJF0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpr55Q3UJF0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpr55Q3UJF0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms