Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm648Q3UJ22 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Gm648Q3UJ22 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm648Q3UJ22 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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