Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Parp8Q3UD82 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Parp8Q3UD82 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Parp8Q3UD82 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Parp8Q3UD82 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Parp8Q3UD82 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Parp8Q3UD82 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp8Q3UD82 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms