Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trip13Q3UA06 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms