Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LbrQ3U9G9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LbrQ3U9G9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LbrQ3U9G9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LbrQ3U9G9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LbrQ3U9G9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LbrQ3U9G9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LbrQ3U9G9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LbrQ3U9G9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LbrQ3U9G9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LbrQ3U9G9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LbrQ3U9G9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LbrQ3U9G9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LbrQ3U9G9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LbrQ3U9G9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LbrQ3U9G9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LbrQ3U9G9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LbrQ3U9G9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LbrQ3U9G9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LbrQ3U9G9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LbrQ3U9G9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LbrQ3U9G9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LbrQ3U9G9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LbrQ3U9G9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LbrQ3U9G9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LbrQ3U9G9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LbrQ3U9G9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LbrQ3U9G9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LbrQ3U9G9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LbrQ3U9G9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LbrQ3U9G9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LbrQ3U9G9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LbrQ3U9G9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LbrQ3U9G9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LbrQ3U9G9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LbrQ3U9G9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LbrQ3U9G9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LbrQ3U9G9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LbrQ3U9G9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LbrQ3U9G9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LbrQ3U9G9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LbrQ3U9G9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LbrQ3U9G9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LbrQ3U9G9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LbrQ3U9G9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LbrQ3U9G9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LbrQ3U9G9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LbrQ3U9G9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LbrQ3U9G9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LbrQ3U9G9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LbrQ3U9G9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LbrQ3U9G9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LbrQ3U9G9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LbrQ3U9G9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LbrQ3U9G9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LbrQ3U9G9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LbrQ3U9G9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LbrQ3U9G9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LbrQ3U9G9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LbrQ3U9G9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LbrQ3U9G9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LbrQ3U9G9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LbrQ3U9G9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LbrQ3U9G9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LbrQ3U9G9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LbrQ3U9G9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LbrQ3U9G9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LbrQ3U9G9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LbrQ3U9G9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LbrQ3U9G9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LbrQ3U9G9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LbrQ3U9G9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LbrQ3U9G9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LbrQ3U9G9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LbrQ3U9G9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LbrQ3U9G9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LbrQ3U9G9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LbrQ3U9G9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LbrQ3U9G9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LbrQ3U9G9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LbrQ3U9G9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LbrQ3U9G9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LbrQ3U9G9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LbrQ3U9G9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LbrQ3U9G9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LbrQ3U9G9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LbrQ3U9G9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LbrQ3U9G9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LbrQ3U9G9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LbrQ3U9G9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LbrQ3U9G9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LbrQ3U9G9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LbrQ3U9G9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LbrQ3U9G9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LbrQ3U9G9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LbrQ3U9G9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LbrQ3U9G9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LbrQ3U9G9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LbrQ3U9G9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LbrQ3U9G9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms