Protein–RNA interactions for Protein: Q3U7U4

Transmembrane protein C1orf162 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U7U4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3U7U4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3U7U4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3U7U4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3U7U4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3U7U4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3U7U4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3U7U4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3U7U4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3U7U4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3U7U4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3U7U4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3U7U4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3U7U4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3U7U4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3U7U4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3U7U4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3U7U4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3U7U4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3U7U4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3U7U4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3U7U4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3U7U4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3U7U4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3U7U4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3U7U4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3U7U4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3U7U4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3U7U4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3U7U4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3U7U4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3U7U4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3U7U4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3U7U4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3U7U4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3U7U4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3U7U4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3U7U4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q3U7U4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q3U7U4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3U7U4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3U7U4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3U7U4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3U7U4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3U7U4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3U7U4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3U7U4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3U7U4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3U7U4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3U7U4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3U7U4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3U7U4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3U7U4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3U7U4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3U7U4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3U7U4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3U7U4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3U7U4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3U7U4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3U7U4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3U7U4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3U7U4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3U7U4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3U7U4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3U7U4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3U7U4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3U7U4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3U7U4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3U7U4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3U7U4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3U7U4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3U7U4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3U7U4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3U7U4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3U7U4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3U7U4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Q3U7U4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q3U7U4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3U7U4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3U7U4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Q3U7U4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3U7U4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Q3U7U4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3U7U4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3U7U4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3U7U4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3U7U4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3U7U4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3U7U4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3U7U4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3U7U4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3U7U4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3U7U4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3U7U4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3U7U4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3U7U4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3U7U4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3U7U4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3U7U4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3U7U4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms