Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtpbp6Q3U6U5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
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