Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U595 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U595 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U595 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U595 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U595 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U595 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U595 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U595 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U595 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U595 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U595 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U595 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U595 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U595 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U595 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U595 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U595 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U595 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U595 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U595 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U595 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U595 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U595 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U595 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U595 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U595 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U595 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U595 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U595 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U595 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U595 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U595 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U595 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U595 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U595 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U595 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U595 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U595 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U595 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U595 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U595 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U595 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Q3U595 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U595 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U595 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U595 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U595 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U595 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U595 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U595 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Q3U595 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q3U595 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q3U595 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q3U595 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q3U595 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q3U595 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q3U595 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Q3U595 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q3U595 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Q3U595 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q3U595 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q3U595 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q3U595 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q3U595 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q3U595 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Q3U595 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q3U595 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q3U595 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Q3U595 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Q3U595 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q3U595 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q3U595 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q3U595 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q3U595 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q3U595 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q3U595 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Q3U595 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q3U595 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q3U595 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q3U595 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Q3U595 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Q3U595 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q3U595 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q3U595 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q3U595 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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