Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VwceQ3U515 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VwceQ3U515 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VwceQ3U515 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VwceQ3U515 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VwceQ3U515 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VwceQ3U515 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VwceQ3U515 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
VwceQ3U515 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VwceQ3U515 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VwceQ3U515 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VwceQ3U515 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VwceQ3U515 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VwceQ3U515 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VwceQ3U515 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
VwceQ3U515 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VwceQ3U515 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VwceQ3U515 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VwceQ3U515 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VwceQ3U515 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VwceQ3U515 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VwceQ3U515 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VwceQ3U515 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VwceQ3U515 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VwceQ3U515 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VwceQ3U515 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VwceQ3U515 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VwceQ3U515 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VwceQ3U515 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VwceQ3U515 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VwceQ3U515 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VwceQ3U515 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VwceQ3U515 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VwceQ3U515 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VwceQ3U515 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VwceQ3U515 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VwceQ3U515 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VwceQ3U515 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VwceQ3U515 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VwceQ3U515 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VwceQ3U515 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VwceQ3U515 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VwceQ3U515 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VwceQ3U515 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VwceQ3U515 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VwceQ3U515 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VwceQ3U515 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VwceQ3U515 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VwceQ3U515 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VwceQ3U515 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
VwceQ3U515 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VwceQ3U515 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VwceQ3U515 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VwceQ3U515 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VwceQ3U515 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VwceQ3U515 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VwceQ3U515 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
VwceQ3U515 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VwceQ3U515 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VwceQ3U515 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VwceQ3U515 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VwceQ3U515 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms