Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc174Q3U155 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc174Q3U155 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc174Q3U155 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc174Q3U155 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc174Q3U155 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc174Q3U155 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc174Q3U155 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc174Q3U155 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc174Q3U155 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc174Q3U155 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc174Q3U155 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc174Q3U155 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc174Q3U155 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc174Q3U155 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc174Q3U155 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc174Q3U155 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms