Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Palb2Q3U0P1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Palb2Q3U0P1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Palb2Q3U0P1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Palb2Q3U0P1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms