Protein–RNA interactions for Protein: Q3TY92

Mbd6, Methyl-CpG-binding domain protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd6Q3TY92 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd6Q3TY92 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd6Q3TY92 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms