Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXX4

Slc17a7, Vesicular glutamate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc17a7Q3TXX4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc17a7Q3TXX4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc17a7Q3TXX4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc17a7Q3TXX4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc17a7Q3TXX4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc17a7Q3TXX4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc17a7Q3TXX4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc17a7Q3TXX4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Slc17a7Q3TXX4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc17a7Q3TXX4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms