Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWL2

Pip4p1, Type 1 phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 4-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pip4p1Q3TWL2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pip4p1Q3TWL2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pip4p1Q3TWL2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pip4p1Q3TWL2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pip4p1Q3TWL2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pip4p1Q3TWL2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pip4p1Q3TWL2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pip4p1Q3TWL2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pip4p1Q3TWL2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pip4p1Q3TWL2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pip4p1Q3TWL2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pip4p1Q3TWL2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pip4p1Q3TWL2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms