Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccndbp1Q3TVC7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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