Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3TTL0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3TTL0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3TTL0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3TTL0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3TTL0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3TTL0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3TTL0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3TTL0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3TTL0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3TTL0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3TTL0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3TTL0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3TTL0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3TTL0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3TTL0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3TTL0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3TTL0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3TTL0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3TTL0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3TTL0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3TTL0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3TTL0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3TTL0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3TTL0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3TTL0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3TTL0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3TTL0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3TTL0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3TTL0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3TTL0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3TTL0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3TTL0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3TTL0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3TTL0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3TTL0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3TTL0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3TTL0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Q3TTL0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3TTL0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3TTL0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3TTL0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3TTL0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3TTL0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3TTL0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3TTL0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3TTL0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TTL0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TTL0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms