Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT99

Gdpd4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd4Q3TT99 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gdpd4Q3TT99 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gdpd4Q3TT99 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gdpd4Q3TT99 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gdpd4Q3TT99 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gdpd4Q3TT99 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gdpd4Q3TT99 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gdpd4Q3TT99 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gdpd4Q3TT99 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gdpd4Q3TT99 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gdpd4Q3TT99 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gdpd4Q3TT99 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gdpd4Q3TT99 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gdpd4Q3TT99 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gdpd4Q3TT99 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gdpd4Q3TT99 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gdpd4Q3TT99 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gdpd4Q3TT99 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gdpd4Q3TT99 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gdpd4Q3TT99 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gdpd4Q3TT99 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gdpd4Q3TT99 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gdpd4Q3TT99 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gdpd4Q3TT99 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gdpd4Q3TT99 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gdpd4Q3TT99 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gdpd4Q3TT99 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gdpd4Q3TT99 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gdpd4Q3TT99 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gdpd4Q3TT99 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gdpd4Q3TT99 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gdpd4Q3TT99 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gdpd4Q3TT99 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms