Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT38

D17Wsu92e, Uncharacterized protein C6orf106 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17Wsu92eQ3TT38 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
D17Wsu92eQ3TT38 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
D17Wsu92eQ3TT38 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
D17Wsu92eQ3TT38 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
D17Wsu92eQ3TT38 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
D17Wsu92eQ3TT38 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
D17Wsu92eQ3TT38 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
D17Wsu92eQ3TT38 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
D17Wsu92eQ3TT38 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
D17Wsu92eQ3TT38 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
D17Wsu92eQ3TT38 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
D17Wsu92eQ3TT38 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
D17Wsu92eQ3TT38 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
D17Wsu92eQ3TT38 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
D17Wsu92eQ3TT38 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
D17Wsu92eQ3TT38 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
D17Wsu92eQ3TT38 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
D17Wsu92eQ3TT38 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
D17Wsu92eQ3TT38 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
D17Wsu92eQ3TT38 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
D17Wsu92eQ3TT38 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
D17Wsu92eQ3TT38 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
D17Wsu92eQ3TT38 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
D17Wsu92eQ3TT38 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
D17Wsu92eQ3TT38 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
D17Wsu92eQ3TT38 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
D17Wsu92eQ3TT38 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
D17Wsu92eQ3TT38 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
D17Wsu92eQ3TT38 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
D17Wsu92eQ3TT38 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
D17Wsu92eQ3TT38 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
D17Wsu92eQ3TT38 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
D17Wsu92eQ3TT38 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
D17Wsu92eQ3TT38 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
D17Wsu92eQ3TT38 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
D17Wsu92eQ3TT38 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
D17Wsu92eQ3TT38 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
D17Wsu92eQ3TT38 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
D17Wsu92eQ3TT38 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
D17Wsu92eQ3TT38 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
D17Wsu92eQ3TT38 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
D17Wsu92eQ3TT38 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
D17Wsu92eQ3TT38 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
D17Wsu92eQ3TT38 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
D17Wsu92eQ3TT38 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms