Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSG4

Alkbh5, RNA demethylase ALKBH5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh5Q3TSG4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Alkbh5Q3TSG4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Alkbh5Q3TSG4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Alkbh5Q3TSG4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Alkbh5Q3TSG4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Alkbh5Q3TSG4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Alkbh5Q3TSG4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Alkbh5Q3TSG4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alkbh5Q3TSG4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alkbh5Q3TSG4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alkbh5Q3TSG4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alkbh5Q3TSG4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alkbh5Q3TSG4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alkbh5Q3TSG4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alkbh5Q3TSG4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alkbh5Q3TSG4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alkbh5Q3TSG4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alkbh5Q3TSG4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alkbh5Q3TSG4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alkbh5Q3TSG4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alkbh5Q3TSG4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alkbh5Q3TSG4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alkbh5Q3TSG4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alkbh5Q3TSG4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alkbh5Q3TSG4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alkbh5Q3TSG4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Alkbh5Q3TSG4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Alkbh5Q3TSG4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Alkbh5Q3TSG4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Alkbh5Q3TSG4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Alkbh5Q3TSG4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Alkbh5Q3TSG4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Alkbh5Q3TSG4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms