Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Calr4Q3TQS0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms