Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CiartQ3TQ03 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms