Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctdnep1Q3TP92 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctdnep1Q3TP92 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctdnep1Q3TP92 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctdnep1Q3TP92 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctdnep1Q3TP92 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctdnep1Q3TP92 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctdnep1Q3TP92 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctdnep1Q3TP92 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctdnep1Q3TP92 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctdnep1Q3TP92 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctdnep1Q3TP92 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctdnep1Q3TP92 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctdnep1Q3TP92 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctdnep1Q3TP92 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctdnep1Q3TP92 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctdnep1Q3TP92 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctdnep1Q3TP92 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctdnep1Q3TP92 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctdnep1Q3TP92 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctdnep1Q3TP92 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctdnep1Q3TP92 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctdnep1Q3TP92 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctdnep1Q3TP92 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctdnep1Q3TP92 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctdnep1Q3TP92 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctdnep1Q3TP92 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctdnep1Q3TP92 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctdnep1Q3TP92 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctdnep1Q3TP92 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctdnep1Q3TP92 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctdnep1Q3TP92 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctdnep1Q3TP92 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctdnep1Q3TP92 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctdnep1Q3TP92 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctdnep1Q3TP92 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctdnep1Q3TP92 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctdnep1Q3TP92 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctdnep1Q3TP92 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctdnep1Q3TP92 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctdnep1Q3TP92 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctdnep1Q3TP92 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctdnep1Q3TP92 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctdnep1Q3TP92 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctdnep1Q3TP92 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctdnep1Q3TP92 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctdnep1Q3TP92 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctdnep1Q3TP92 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctdnep1Q3TP92 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctdnep1Q3TP92 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctdnep1Q3TP92 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctdnep1Q3TP92 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctdnep1Q3TP92 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctdnep1Q3TP92 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctdnep1Q3TP92 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctdnep1Q3TP92 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctdnep1Q3TP92 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctdnep1Q3TP92 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctdnep1Q3TP92 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctdnep1Q3TP92 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctdnep1Q3TP92 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms