Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms