Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDQ1

Stt3b, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3B, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stt3bQ3TDQ1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Stt3bQ3TDQ1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Stt3bQ3TDQ1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Stt3bQ3TDQ1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stt3bQ3TDQ1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stt3bQ3TDQ1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stt3bQ3TDQ1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stt3bQ3TDQ1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stt3bQ3TDQ1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stt3bQ3TDQ1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Stt3bQ3TDQ1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stt3bQ3TDQ1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Stt3bQ3TDQ1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms