Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc69Q3TCJ8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc69Q3TCJ8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc69Q3TCJ8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc69Q3TCJ8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc69Q3TCJ8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc69Q3TCJ8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc69Q3TCJ8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc69Q3TCJ8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc69Q3TCJ8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc69Q3TCJ8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc69Q3TCJ8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc69Q3TCJ8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc69Q3TCJ8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc69Q3TCJ8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc69Q3TCJ8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc69Q3TCJ8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc69Q3TCJ8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc69Q3TCJ8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc69Q3TCJ8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc69Q3TCJ8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc69Q3TCJ8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc69Q3TCJ8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc69Q3TCJ8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc69Q3TCJ8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc69Q3TCJ8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc69Q3TCJ8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc69Q3TCJ8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc69Q3TCJ8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc69Q3TCJ8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc69Q3TCJ8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc69Q3TCJ8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc69Q3TCJ8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc69Q3TCJ8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc69Q3TCJ8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc69Q3TCJ8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc69Q3TCJ8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc69Q3TCJ8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc69Q3TCJ8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc69Q3TCJ8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc69Q3TCJ8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc69Q3TCJ8 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc69Q3TCJ8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc69Q3TCJ8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc69Q3TCJ8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc69Q3TCJ8 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc69Q3TCJ8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms