Protein–RNA interactions for Protein: Q3TAP4

Ap5b1, AP-5 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap5b1Q3TAP4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ap5b1Q3TAP4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ap5b1Q3TAP4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ap5b1Q3TAP4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ap5b1Q3TAP4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ap5b1Q3TAP4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms