Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M3Q31093 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms