Protein–RNA interactions for Protein: Q2TJ95

Rspo3, R-spondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo3Q2TJ95 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rspo3Q2TJ95 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms